ALVES, LÍVIA; SILVA, JONATHAS M. P.. Transformações edilícias e viárias nos municípios de Cuiabá e Várzea Grande:. REVISTA DE MORFOLOGIA URBANA. , v.11, p.291 - 310, 2023.
​
MANETTI, C.; SILVA, Jonathas M. P.. Estrutura Urbana Brasileira: as sete transversais intermetropolitanas. Cadernos do PROARQ (UFRJ). , v.1, p.122 - 139, 2021.
​
​
DOSSO, T. C. ; SILVA, Jonathas M. P. . A transformação da paisagem na favela objeto de regularização fundiária. RISCO (SÃO CARLOS), v. 19, p. 1-8, 2021.
​
SILVA, Jonathas M. P.; TOLEDO, L. C. . O exercício de pensar a cidade imaginária. Cadernos do PROARQ (UFRJ), v. 36, p. 1-18, 2021.
​
GALVAO, C. ; SILVA, Jonathas M. P. . Um estudo sobre o controle arquitetônico de infecções hospitalares em 1980: caso do Hospital Regional de Chapecó - SC. Revista IPH, v. 17, p. 1-15, 2021.
​
SILVA, Jonathas M. P.; SILVA, I. F. ; SILVA, T. I. ; KUHL, C. G. . O desafio de caracterizar as localizações das classes populares. Cartografias das transformações do Alto Tietê Cabeceiras SP entre 2006 e 2016. ARQUITEXTOS (SÃO PAULO), v. 22, p. 1, 2021.
​
RIPOLI, Mariana ; SILVA, Jonathas M. P. . Apropriação dos espaços livres. O caso da Avenida Paulista. ARQUITEXTOS (SÃO PAULO), v. 1, p. 1, 2020.
​
OKANO, M. M. S. ; BENFATTI, Denio Munia ; SILVA, Jonathas M. P. . Aterros na ilha de Santa Catarina: transformações e valores do espaço público. Cadernos do Proarq, v. 35, p. 62-85, 2020.
​
BORGES, L. B. O. ; SILVA, JONATHAS MAGALHÃES PEREIRA DA . Corrupção urbanística em sistemas de planejamento e gestão urbanos: um estudo de caso. URBE. REVISTA BRASILEIRA DE GESTÃO URBANA, v. 11, p. 1-17, 2019.
​
CAMPOS, G. H. L. ; SILVA, Jonathas M. P. . Arco Metropolitano do Rio de Janeiro: sob o signo da transnacionalização. CADERNOS DO PROARQ (UFRJ), v. 33, p. 1-16, 2019.
​
SILVA, Jonathas M. P.; ROMERA, C. G. ; GONCALVES, A. C. V. . Transformação, forma urbana e localização de renda: identificação de padrões nas cidades brasileiras. RISCO Revista em arquitetura e Urbanismo, v. 17, p. 86-113, 2019.
​
MANETTI, C. ; SILVA, JONATHAS MAGALHÃES PEREIRA DA . A Multiplicidade do Espaço como Reflexão Dialética. PAISAGEM E AMBIENTE, v. 1, p. 23-34, 2018.
​
BORGES, L. B. O. ; SILVA, JONATHAS MAGALHÃES PEREIRA DA . Corrupção Urbanística, política e participação: a construção social da cidade. REVISTA BRASILEIRA DE DIREITO URBANÍSTICO, v. 4, p. 113-135, 2018.
​
SILVA, Jonathas M. P.; BENFATTI, D. ; MOREIRA, T. ; RIBEIRO, J. A. Z. M. T. . Prática de ensino de planejamento urbano e regional Desenho como ferramenta de discussão e agentes como protagonistas. ARQUITEXTOS (SÃO PAULO), v. 191.07, p. 1-17, 2016.
​
MANETTI, C. ; SILVA, Jonathas M. P. . José Calazans: Arquitetura, Dialética e Projeto ? Parte I - Turbulência. Arquitextos (São Paulo), v. 16, p. 186-03, 2015.
​
MANETTI, C. ; SILVA, Jonathas M. P. . José Calazans: Arquitetura, Dialética e Projeto ? Parte II - Negação. Arquitextos (São Paulo), v. 16, p. 187-01-1, 2015.
​
SILVA, Jonathas M. P.; LIMA, F. C. ; MAGALHÃES, Natália C. T. . Aplicação de Método de analise em três diferentes escalas: padrões e tipos morfológicos da Região Metropolitana de Campinas, SP, Brasil. REVISTA DE MORFOLOGIA URBANA, v. 1, p. 105-120, 2015.
​
PARHAYBA, N. ; SILVA, Jonathas M. P. . A morfologia urbana como leitura das dinâmicas existentes nos espaços livres em Campinas - SP. Cadernos do PROARQ (UFRJ), v. 1, p. 36-59, 2015.
​
SILVA, Jonathas M. P.; BENFATTI, Denio Munia ; MOREIRA, T. A. ; PERA, C. K. L. . Os papéis dos espaços livres públicos na estruturação territorial e no projeto de parcelamento: a experiência de ensino na PUC-Campinas. PAISAGEM E AMBIENTE, p. 165, 2014.
​
SILVA, Jonathas M. P.; BENFATTI, Denio Munia ; SANTOS JUNIOR, W. R. ; PEZZUTO, C. C. . Critérios para intervenções e transformação do sistema de espaços livres: uma reflexão conceitual e metodológica. PAISAGEM E AMBIENTE, p. 11, 2014.
​
BENFATTI, Denio Munia ; SILVA, Jonathas M. P. . App e parques lineares: adoção de conceito ou arquétipo? - DOI: 10.5752/P.2316-1752.2013v20n27p78. CADERNOS DE ARQUITETURA E URBANISMO (PUCMG), v. 20, p. 1-19, 2014.
​
SILVA, Jonathas M. P.; BENFATTI, Denio Munia ; SANTOS JUNIOR, W. R. ; PEZZUTO, C. C. . Critérios para intervenções e transformação do sistema de espaços livres: uma reflexão conceitual e metodológica. Paisagem e Ambiente, v. 1, p. 11-28, 2014.
​
​
SILVA, Jonathas M. P.; MANETTI, C. ; TANGARI, V. R. . Compartilhamentos e Unidades de Paisagem: Método de Leitura da Paisagem Aplicado à Linha Férrea. PAISAGEM E AMBIENTE, p. 61, 2013.
​
SILVA, Jonathas M. P.; MAGALHÃES, Natália C. T. . Contradições da Região Metropolitana de Campinas: delimitação das ZEIS e a localização dos investimentos públicos em habitação de interesse social. ARQUITEXTOS (SÃO PAULO), v. 14, p. 1-10, 2013.
​
SILVA, Jonathas M. P.. As Unidades de Paisagem como Método de Analise da Forma urbana: reflexões sobre sua incorporação pelo campo disciplinar da arquitetura e urbanismo. Cadernos do PROARQ (UFRJ), v. 20, p. 71-93, 2013.
​
BUENO, L. M. ; TANGARI, V. R. ; SILVA, Jonathas M. P. ; PEZZUTO, C. C. ; MONTEZUMA, R. ; REGO, A. Q. . Mudanças Climáticas e as Formas de Ocupação Urbana: Processo de Criação de Cenários Socioambientais. PAISAGEM E AMBIENTE, p. 123, 2012.
​
SILVA, Jonathas M. P.; MANETTI, C. . Memória, Mobilidade e Complexidade: Consideração pela História Local. Risco: Revista de Pesquisa em Arquitetura e Urbanismo (on line), v. 16, p. 61-77, 2012.
SILVA, Jonathas M. P.. Localização das ZEIS na Região Metropolitana de Campinas: uma analise das legislações municipais. Cadernos do PROARQ (UFRJ), v. 1, p. 80-89, 2011.
​
SILVA, JONATHAS MAGALHÃES PEREIRA DA. Habitação de interesse social e as legislações municipais da região metropolitana de Campinas. AMBIENTE CONSTRUÍDO (ONLINE), v. 11, p. 55-67, 2011.
​
BENFATTI, Denio Munia ; QUEIROGA, Eugenio Fernandes ; SILVA, Jonathas M. P. . Transformações da metrópole contemporânea: novas dinâmicas espaciais, esfera da vida pública e sistema de espaços livres. Revista Brasileira de Estudos Urbanos e Regionais (ANPUR), v. 12, p. 25-44, 2010.
​
SILVA, Jonathas M. P.. Segregação socioespacial: contradições presentes em Palmas/TO. Risco: Revista de Pesquisa em Arquitetura e Urbanismo (on line), v. 0, p. 124, 2009.
​
SILVA, Jonathas M. P.. Ensino do Planejamento Urbano e Regional: Leitura dos Conflitos e Potencialidades. Cadernos do PROARQ (UFRJ), v. 1, p. 40-59, 2009.
​
SILVA, Jonathas M. P.. Ensino Arquitetura e a Faculdade de Arquitetura e Urbanismo da USP. Academia (FAU/UFRJ), v. 8, p. 10-20, 2007.
​
SILVA, Jonathas M. P.. Os papéis da disciplina de paisagismo: uma discussão a respeito do universo necessário para promover um avanço à inserção da disciplina de paisagismo no curso de Arquitetura e Urbanismo. PAISAGEM E AMBIENTE, p. 335, 2007.
​
SILVA, Jonathas M. P.; TANGARI, V. R. . A transformação da paisagem: planos diretores em onze municípios do Espírito Santo, um estudo de caso. PAISAGEM E AMBIENTE, p. 345, 2007.
​
SILVA, Jonathas M. P.. Transcrição da Entrevista Concedida por Miranda Maria Esmeralda Martinelli Magnoli. Paisagem e Ambiente, v. 24, p. 10-20, 2006.
​
SILVA, Jonathas M. P.; TANGARI, V. R. . A transformação da paisagem. Cadernos do PROARQ (UFRJ), v. 10, p. 90-97, 2006.
​
SILVA, Jonathas M. P.. Retrospectiva e método de criação de instrumentos para o ensino de paisagismo. Paisagem e Ambiente, SÃO PAULO, v. 15, p. 10-20, 2002.
